FAT 16, VFAT, FAT 32

El más extendido es el FAT 16 de las versiones de DOS superiores a la 3 y del Windows 95 original, usado en los disquetes y la mayoría de los Discos Duros. La VFAT (FAT Virtual) de Windows 95 que permite nombres largos no es más que un parche sobre este sistema de archivo, no un sistema de archivo en si.

El FAT 32 de Windows 98, ME y de la versión OS R-2 de Windows 95. Las ventajas de este sistema dde archivo frente al anterior radican en que es de 32 bits y tiene un tamaño de cluster muy pequeño, lo que le hace capaz de admitir grandes Discos Duros y aprovecharlos muy bien, además de no necesitar artificios como VFAT para usar nombres largos de archivo.